Менеджер программ является оболочкой, при помощи которой пользователь может организовать свои приложения в группы, оформляя каждую группу в виде независимого группового окна, которое является дочерним окном менеджера программ. Обычно групповые окна организуются по схожему назначению программ, их принадлежности и какому-либо пакету программ, или по другому признаку. Одно и то же приложение может содержаться в различных групповых окнах. Групповые окна могут быть распахнуты, свернуты, открыты, как обычные и дочерние окна, но они всегда располагаются в рабочей области менеджера программ. В стандартном варианте обязательно присутствуют следующие групповые окна:
Основная группа окна (Главная, Main). В нее входят наиболее важные утилиты для работы с Windows, в частности, Менеджер Файлов (File Manager), Контрольная панель (Control Panel), Поддержка DOS (DOS Prompt);
Добавочная группа (Accessories), которая включает поставляемые с Windows приложения;
Игровая группа (Games), которая включает в себя игры, поставляемые с Windows. Группа приложений (Applications), которая включает приложения DOS и Windows, не входящие в дистрибутив Windows 3.11.